Znaczny udział w domenie diagnostyki różnych jednostek chorobowych ma pozytonowa tomografia emisyjna w Krakowie i innych miejscach Polski. Jej skuteczność stosuje się przede wszystkim w poszukiwaniu zmian nowotworowych, ale i lepszym diagnozowaniu chorób neurologicznych, takich jak Alzheimer, Parkinson czy padaczka. Pacjenci cierpiący na schizofrenię dodatkowo mogą być skutecznie badani w ten sposób.
Aby bardzo sprawnie zobrazować wewnętrzny stan organizmu chorego wykonywana jest pozytonowa tomografia emisyjna (PET). Placówki z Krakowa wykonują tego typu badanie na zasadzie świadczenia NFZ. Polega ono na wprowadzeniu do ciała pacjenta substancji radioizotopowej i obserwowanie drogi obieranej przez ulegające rozpadowi cząsteczki. Ruch fotonów jest śledzony przez specjalne urządzenie obrazujące i transmitowane na monitor komputera.
Niekwestionowaną wartością tego, że pacjent zostaje objęty pozytonową tomografią emisyjną w Krakowie, jest krótki czas połowicznego rozpadu związku promieniotwórczego. Oznacza to, że narządy wewnętrzne pacjenta nie są narażone na wpływanie związków radioaktywnych przez długi czas. Używany do wizualizowania izotop 18F ulega połowicznemu rozpadowi po niespełna dwóch godzinach. Do badania tego najczęściej wykorzystywany jest związek chemiczny F18-FDG. Jest to fludeoksyglukoza, która w swoim składzie ma promieniotwórczy fluor. Substancja ta jest przyswajana wyjątkowo dobrze przez wszelakie komórki ciała, co przyczynia się do skuteczności badania.